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Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.2 KB  |  43 lines
  1. ***********************************************
  2. * Formate--tetrahydrofolate ligase signatures *
  3. ***********************************************
  4.  
  5. Formate--tetrahydrofolate    ligase   (EC 6.3.4.3)     (formyltetrahydrofolate
  6. synthetase) (FTHFS)  is  one of the enzymes  participating  in the transfer of
  7. one-carbon units, an  essential element of various biosynthetic pathways.   In
  8. many of these processes the transfers of  one-carbon units are mediated by the
  9. coenzyme   tetrahydrofolate  (THF).   Various  reactions  generate  one-carbon
  10. derivatives of THF  which can be  interconverted  between  different oxidation
  11. states  by  FTHFS,  methylenetetrahydrofolate dehydrogenase  (EC 1.5.1.5)  and
  12. methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase (EC 3.5.4.9).
  13.  
  14. In eukaryotes  the  FTHFS  activity  is expressed by a multifunctional enzyme,
  15. C-1-tetrahydrofolate  synthase (C1-THF synthase),  which  also  catalyzes  the
  16. dehydrogenase and cyclohydrolase activities. Two forms of C1-THF synthases are
  17. known [1],  one  is located in the mitochondrial  matrix, while the second one
  18. is cytoplasmic.  In  both forms  the FTHFS domain  consist of  about 600 amino
  19. acid residues  and is located in the C-terminal section of C1-THF synthase. In
  20. prokaryotes FTHFS  activity is  expressed by  a  monofunctional homotetrameric
  21. enzyme of about 560 amino acid residues [2].
  22.  
  23. The sequence of FTHFS  is  highly conserved  in  all  forms of the enzyme.  As
  24. signature  patterns  we  selected  two  regions  that   are  almost  perfectly
  25. conserved. The first one is a  glycine-rich segment located  in the N-terminal
  26. part of FTHFS and which could be part of an ATP-binding domain [2]. The second
  27. pattern is located in the central section of FTHFS.
  28.  
  29. -Consensus pattern: G-[LIVM]-K-G-G-A-A-G-G-G-Y
  30. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  31. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  32.  
  33. -Consensus pattern: V-A-T-V-R-A-L-K-x-H-G-G
  34. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  35. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  36.  
  37. -Last update: December 1992 / First entry.
  38.  
  39. [ 1] Shannon K.W., Rabinowitz J.C.
  40.      J. Biol. Chem. 263:7717-7725(1988).
  41. [ 2] Lovell C.R., Przybyla A., Ljungdahl L.G.
  42.      Biochemistry 29:5687-5694(1990).
  43.